Обеззараживание воды, поступающей из при­родных водоемов, проводится у нас в основ­ном методом глубокого хлорирования, от ко­торого отказались уже во многих странах. Применяемое для обеззараживания воды хлорирование образует огромное количество хлорной органики. На сегодняшний день открыто 3000 видов хлорорганических примесей, 600 из которых являются сильнейшими канцерогенами и вызывают такие заболевания, как рак мочевого пузыря, желудочно-кишечного тракта, печени. Производные хлора (хло­роформ, хлорфенол, хлориды, тригалометаны, остаточный хлор - всего 11 соедине­ний) обладают онкогенным и мутагенным действиями, то есть способны влиять на ге­нетический аппарат человека. Если же в во­ду попадет фенол, то такое сочетание чре­вато образованием диоксинов, которые от­носятся к категории особо опасных ядов даже в микроскопически малых дозах. По данным центра по изучению исполнения законов США, хлор, вступив в реакцию с жирными кислотами и частицами угля, об­разует разнообразные токсичные соедине­ния, которые составляют около 30% объема хлорированной воды. Доказано, что хлор и его соединения сни­жают иммунитет, провоцируя респираторно-вирусные заболевания, пневмонию, гастриты, спонтанные аборты. Сочетание хлора и жи­ров вызывает атеросклероз и инфаркты.  После того как в 1904 году началось хлори­рование воды, началась и современная эпиде­мия сердечных болезней, рака и слабоумия, считает доктор Прайс из госпиталя Сагино. По данным Совета по качеству окружающей среды США, известные канцерогены находятся в питьевой воде как прямой результат ее хлори­рования. Таким образом, риск заболевания ра­ком среди тех, кто пьет хлорированную воду, на 93% выше, чем среди тех, кто пьет воду, в кото­рой хлор отсутствует. До конца XIX века эпидемии холеры, брюшного тифа, дизентерии выкашивали целые города. Но более 100 лет тому назад выяснилось, что при растворении в воде газообразного хлора происходит ее обеззараживание, и во многих странах приступили к широкомасштабному хлорированию питьевой воды.  И хотя исследования последних лет пока­зали, что многие вирусные загрязнения ус­тойчивы к воздействию хлора, в России его продолжают активно применять для обезза­раживания воды. Более того, в Новых сани­тарных правилах и нормах РФ 1996 года «Питьевая вода» нормы содержания хлора в воде увеличены более чем в три раза. При хлорировании воды, содержащей органические соединения, в ней образуются хлороформ и другие побочные продукты дезинфкции – хлоруксусная кислота, хлоркетоны, хлорзамещенные бифенилы, диоксин. У людей потребляющих хлорированную воду из поверхностных вод, богатых органикой, по сравнению с теми, кто пил воду из подземных источников, возрастает риск заболевания  сердечно-сосудистыми и почечными заболеваниями, спонтанных абортов, и врожденных уродств. До начала повсеместного хлорирования воды диагноз «атеросклероз» ставили очень редко, а смертность от сердечно-сосудистых заболеваний не превышала 9 %. Уже в 20 – е годы частота атеросклеротических повреждений сосудов возросла, а к концу ХХ века серддечно-сосудистые заболевания вышли на первое место как причина смертности. Появляются утверждения, что хлорирование воды, содержащей органику – основная причина эпидемии сердечно-сосудистых заболеваний в ХХ веке. Обезопасить себя от хлорорганичеких соединений в воде можно используя воду из подземных источников, не содержащих органики, и применением специальных фильтров для очистки воды, идущей на приготовление пищи. Особого внимания требует задача предотвращения биообрастания и повторного роста микроорганизмов в распределительных сетях. В настоящее время в практике водоподготовки существуют два основных подхода для решения этой задачи - удаление из воды в процессе очистки органических "питательных" веществ и добавление химических реагентов, обеспечивающих "консервирующий" эффект перед подачей воды в разводящую сеть. Первый подход широко распространен в европейских странах, например, применяется в таких крупных городах, как Амстердам и Берлин. В этих городах проблемы биообрастания решаются высокой степенью удаления органического углерода и комплексом мер по поддержанию санитарного состояния сетей. Для обеспечения эффекта последействия наиболее оптимальным считается применение хлораминов. Хлорамины чрезвычайно слабо действуют на вирусы и, как правило, не рекомендуются для основного обеззараживания воды. Однако вследствие более длительного сохранения в сетях и более активного, чем хлор действия по разрушению биопленок в трубах, хлорамины находят все большее применение в практике водоподготовки.